A Coordenadoria Municipal de Defesa Civil tem o objetivo de reduzir os riscos de desastres e compreende ações de prevenção, mitigação, preparação, resposta e recuperação, e se dá de forma multissetorial, com ampla participação da comunidade. O município deve estar preparado para atender imediatamente a população atingida por qualquer tipo de desastre, reduzindo perdas materiais e humanas.

Conforme classificação adotada pelo Sistema Nacional de Proteção e Defesa Civil e aprovada pelo Conselho Nacional Proteção de Defesa Civil, Codificação de Desastres, Ameaças e Riscos, o Brasil apresenta características regionais de desastres, o município de Navegantes, como parte da  Região Sul, tem como principais desastres: inundações, vendavais e granizo.